Volume 49 - Issue 3 - 305 - 311

DNAJC25 as a tumor suppressor candidate gene in breast cancer

Meme Kanserinde tümör baskılayıcı gen adayı olarak DNAJC25


DNAJC25 gene is a member of the HSP40 (DNAJ) family, and it was suggested as a tumor suppressor gene in hepatocellular carcinoma. The aim of this study was to analyze the expression, genetic/epigenetic alterations, and prognostic value of the DNAJC25 gene in breast cancer. DNAJC25 transcript levels are upregulated in BT-20 and ZR-75-1 cell lines and downregulated in MDA-MB-231 cell line compared to the non-tumorigenic mammary epithelial cell line (MCF 10A) (P< 0.05). According to UALCAN in-silico tool, clinical breast cancer samples show significantly reduced levels of DNAJC25 mRNA relative to the normal samples (P=1.47e-02). The Kaplan–Meier plotter tool shows that high DNAJC25 expression is favorable for post-progression survival in breast cancer (P=0.0035). Point mutations or copy number variations of DNAJC25 areuncommon in clinical breast cancer samples. Combined bisulfite restriction analysis (COBRA) results showed that DNAJC25 promoter is not methylated in breast cell lines. Promoter hypomethylation was also observed in normal and tumor clinical samples (Beta-value<0.25). In conclusion, DNAJC25 is suggested as a tumor suppressor candidate having limited biomarker potential in breast cancer. Functional studies are essential to reveal its role in breast carcinogenesis.

DNAJC25 geni HSP40 (DNAJ) ailesinin bir üyesidir ve hepatoselüler karsinomada tümör baskılayıcı gen olarak önerilmiştir. Bu çalışmanın amacı, meme kanserinde DNAJC25 geninin ifadesini, genetik/epigenetik değişimlerini ve prognostik önemini analiz etmekdir. DNAJC25 mRNA ifadesi meme kanseri hücre hatlarında farklılık göstermektedir. Tümörijenik olmayan meme epitel hücre hattına (MCF 10A) göre, DNAJC25 transkript seviyesi BT-20 ve ZR-75-1 hücre hatlarında upregüle olurken, MDA-MB-231 hücre hattında downregüle olmuştur (P<0.05). UALCAN in-siliko aracına göre, klinik meme kanseri örnekleri normal örneklere göre anlamlı oranda düşük DNAJC25 mRNA seviyesi göstermektedir (P=1.47e-02). Kaplan–Meier plot çizerine göre, DNAJC25 ifadesi meme kanserinde post-progres sağ kalımı için olumludur (P=0.0035). DNAJC25 nokta mutasyonları veya kopya sayısı değişimleri klinik meme kanseri örneklerinde nadirdir. Kombine Bisülfit Restriksiyon Analiz (COBRA) sonuçları DNAJC25 promotorunun meme hücre hatlarında metile olmadığını göstermiştir. Promotor hipometilasyonu ayrıca normal ve tümör klinik örneklerinde de gözlenmiştir (Beta-value<0.25). Sonuç olarak, DNAJC25, meme kanserinde biyobelirteç potansiyeli düşük bir tümör baskılayıcı adayı olarak önerilmektedir. Meme kanseri karsinogenezindeki rolünü ortaya çıkarmak için fonksiyonel çalışmalar gereklidir.



Download Article in PDF (1 MB)



Feedback
  • ISSN 1303 5002
  • © 1973-2021 Hacettepe University