Volume 52 - Issue 2 - 129 - 138

Indole-Bearing Azo Compounds: Molecular Docking and in silico ADMET Analysis

İndol içeren Azo Bileşikleri: Moleküler Kenetlenme ve in siliko ADMET Analizi


In this study, the interaction between the 12 indole-bearing azo compounds (a-l), which were previously synthesized by our research group, and two proteins, 2XIR and 5TGZ, was investigated using an in silico method. The ligand-protein interaction parameters and quantities were determined via molecular docking simulation studies. Since compound e has the lowest docking scores for both 2XIR and 5TGZ, it was selected for additional research on binding interactions. Both e-2XIR and e-5TGZ had docking scores that were lower than those of the control molecules. ADMET characteristics (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity) were anticipated using the ADMETlab 2.0 and ProTox-II server. Compound b was categorized as having the greatest levels of toxicity, falling into the sixth toxicity class.

Bu çalışmada araştırma grubumuz tarafından daha önce sentezlenen 12 adet indol içeren azo bileşiği (a-l) ile iki protein (2XIR ve 5TGZ) arasındaki etkileşim in silico yöntem kullanılarak incelendi. Ligand-protein etkileşimi parametreleri ve miktarları, moleküler yerleştirme simülasyon çalışmaları yoluyla belirlendi. Bileşik e, hem 2XIR hem de 5TGZ için en düşük kenetlenme puanlarına sahip olduğundan bağlanma etkileşimleri üzerine ek araştırmalar için seçildi. Hem e-2XIR hem de e-5TGZ, kontrol moleküllerininkinden daha düşük kenetlenme puanlarına sahipti. ADMET özellikleri (emilim, dağılım, metabolizma, atılım ve toksisite), ADMETlab 2.0 ve ProTox-II sunucusu kullanılarak tahmin edildi. Bileşik b, altıncı toksisite sınıfına girerek en yüksek toksisite seviyelerine sahip olarak kategorize edildi.



Download Article in PDF (1.7 MB)



Feedback
  • ISSN 1303 5002
  • © 1973-2024 Hacettepe University